研究中心在厦门大学的指导下,实行主任负责制。研究中心设主任壹名,副主任若干名。主任应具有很高的学术水平,是本领域学术学科带头人,熟悉本学科领域里国内外的发展前沿。具有丰富的教学或科研工作经验,同时应有较强的组织、协调能力。
研究中心坚持“开放、流动、联合、竞争”的运行机制,充分利用现有的科研资源,最大限度地发挥其在人才培养、科学研究、成果转化中的重要作用。在人员管理中,除固定科研人员外,建立人才流动制度,积极引进流动科研人员、访问学者等。
为了保证研究中心的管理、建设和决策等的科学性、合理性,设立研究中心学术委员会。学术委员会是研究中心的学术权威和指导机构,主要负责审议研究中心的研究方向,决定学术方面的重大事宜,审定开放基金项目和其它课题,评估检查课题进展情况,组织学术交流、成果评审等。定期召开学术委员会议。